单个鲑鱼养殖场鲑鱼虱种群的阶段结构贝叶斯层次模型——基于多养殖场数据集估计
种群与进化
2018-08-22 v1 定量方法
应用统计
摘要
鲑鱼养殖在过去几十年已成为繁荣的国际产业。然而，随着养殖鲑鱼产量的增长，病原体威胁日益增加。特别值得关注的是鲑鱼虱（Lepeophtheirus salmonis）的繁殖与传播。为了深入了解这一寄生虫在大规模鲑鱼养殖系统中的种群动态，我们提出了一个完全机械性的鲑鱼虱阶段结构种群模型，该模型还考虑了大规模鲑鱼养殖层次结构中的复杂性。该模型估计控制广泛过程的参数，包括温度依赖性人口统计率、鱼体大小与丰度对虱传播率的影响、各种鲑鱼虱控制措施的效果大小，以及基于距离的养殖场间传播率。模型参数根据包含32个鲑鱼养殖场的数据进行估计，其中5个养殖场的最后生产月份用于评估模型预测。我们采用贝叶斯估计方法，将所有模型参数的先验分布与数据似然组合成联合后验分布。模型生成的期望值较好地拟合了观察到的鲑鱼虱chalimus、成年雌虫及其他活动阶段的感染水平。未用于模型拟合的时间段的预测也与观测数据一致。我们认为，该养殖系统鲑鱼虱种群动态模型有助于解析驱动这种宿主-寄生虫关系的复杂过程，从而改进该生产系统中寄生虫的控制策略。
引用
@article{arxiv.1701.08043,
title = {A stage-structured Bayesian hierarchical model for salmon lice populations at individual salmon farms - Estimated from multiple farm data sets},
author = {Magne Aldrin and Ragnar Bang Huseby and Audun Stien and Randi Nygaard Grøntvedt and Hildegunn Viljugrein and Peder Andreas Jansen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1701.08043},
year = {2018}
}