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基于时空图的混合传染病模型及其在 COVID-19 中的应用

机器学习 2020-10-20 v1 机器学习

摘要

随着 COVID-19 大流行演变,可靠预测对政策制定起着重要作用。经典传染病模型 SEIR(易感-暴露-感染-康复)是一种紧凑却过于简化的时间模型。诸如 RNN(循环神经网络)等数据驱动的机器学习模型在 COVID-19 这类时间序列数据有限的情况下可能表现不佳。本文中,我们在图结构上结合 SEIR 与 RNN,开发一种混合时空模型,以在训练与预测中同时实现准确性与效率。我们在图结构上引入两种特征:节点特征(局部时间感染趋势)与边特征(地理邻域效应)。对于节点特征,我们从 SEIR 导出离散递推式(称为 I-方程),使梯度下降法可直接用于其优化。对于边特征,我们设计 RNN 模型以捕捉邻域效应,并正则化损失函数地形,使局部极小对预测有效且鲁棒。所得混合模型(称为 IeRNN)在美国州级 COVID-19 新增病例数据上的预测精度有所提升,在 1 天和 7 天提前预测中优于标准时间模型(RNN、SEIR 与 ARIMA)。我们的模型适应不同程度的重新开放,并为政策制定者提供潜在结果。

关键词

引用

@article{arxiv.2010.09077,
  title  = {A Spatial-Temporal Graph Based Hybrid Infectious Disease Model with Application to COVID-19},
  author = {Yunling Zheng and Zhijian Li and Jack Xin and Guofa Zhou},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2010.09077},
  year   = {2020}
}