生化系统理论与代谢控制分析的简单比较
分子网络
2024-05-06 v2 定量方法
亚细胞过程
摘要
本文探讨了生化系统理论(BST)与代谢控制分析(MCA)的一些基本概念,这两个框架旨在理解生化网络的行为。BST最初由Savageau提出,侧重于系统稳定性,并在生化系统建模中采用幂律。另一方面,MCA由Kacser和Burns以及Heinrich和Rapoport等作者开创,强调控制方程的线性化,并描述不同度量之间的关系(称为定理)。尽管存在明显差异,但表明这两个框架在许多方面是等价的。通过线性链的简单示例,本文演示了BST和MCA在分析生化途径内的稳态行为和对数增益时如何产生一致的结果。这种比较分析突出了动力学阶、弹性以及其他对数增益等概念的可互换性。
引用
@article{arxiv.2405.00810,
title = {A Simple Comparison of Biochemical Systems Theory and Metabolic Control Analysis},
author = {Herbert M Sauro},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.00810},
year = {2024}
}