以spoIIA操纵子为例的共调控益处定量研究
分子网络
2007-05-23 v1 种群与进化
摘要
大多数基因的分布并非随机，功能相关基因常成簇出现。已有若干理论解释细菌中操纵子的出现与维持。对基因组数据的仔细分析支持共调控模型，即基因组织为操纵子是由协调基因表达与调控的益处所驱动。然而，共表达足以提高个体适应度以保证操纵子形成与维持的直接证据仍缺乏。本文采用先前描述的、控制枯草芽孢杆菌孢子形成中转录因子sigmaF的网络的定量模型，量化由孢子形成基因组织为spoIIA操纵子以及由翻译偶联所产生的益处。分析表明，操纵子组织与翻译偶联之所以重要，是因为基因表达固有的随机性会在无共调控时使蛋白质浓度间比例偏斜。所预测的的不同基因调控形式对适应度与存活的影响与已发表的孢子形成效率在定量上一致。
引用
@article{arxiv.q-bio/0607008,
title = {A quantitative study of the benefits of co-regulation using the spoIIA operon as an example},
author = {Dagmar Iber},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0607008},
year = {2007}
}