神经母细胞瘤中 MYCN 局部鲁棒性的定量分析
分子网络
2016-02-02 v1
摘要
基因 MYCN（V-myc 髓细胞瘤病毒相关癌基因，神经母细胞瘤来源）的扩增是神经母细胞瘤（一种儿童癌症）不良预后的有据可查的指标。不幸的是，在理解神经母细胞瘤背景下 MYCN 的功能方面成功有限，更重要的是，鉴于 MYCN 被视为不可成药，潜在揭示间接靶向 MYCN 的关键机会的需求备受关注。为此，本工作采用网络科学中一种新兴的定量技术，即网络曲率，来量化 MYCN 及其周围邻域的生物学鲁棒性。特别地，当在 IV 期癌症中扩增时，MYCN 表现出比那些 MYCN 表达水平较低的样本更高的曲率（更鲁棒）。在检查周围邻域时，上述论点对网络曲率仍然成立，但仅分析差异表达时则不成立——差异表达是肿瘤学家和计算/分子生物学家常用的技术。这一发现指向了在传统技术中常被混淆的复杂性和间接细胞信号影响背景下的药物靶向问题（及可能解决方案）。
引用
@article{arxiv.1602.00650,
title = {A Quantitative Analysis of Localized Robustness of MYCN in Neuroblastoma},
author = {Romeil Sandhu and Sarah Tannenbaum and Daniel Diolaiti and Alberto Ambesi-Impiombato and Andrew Kung and Allen Tannenbaum},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.00650},
year = {2016}
}