中文

一种用于器官中钙信号动态分析的新配准方法

计算机视觉与模式识别 2018-02-05 v1

摘要

果蝇翅盘囊是研究中生理细胞间钙(Ca2+Ca^{2+})信号以用于器官发育与疾病研究中细胞信号动态分析的有力遗传模型。分析 Ca2+Ca^{2+} 信号波时空模式的关键在于跨图像序列精确对齐囊。然而,由于 Ca2+Ca^{2+} 信号动力学,不同图像帧中的囊可能表现出广泛的强度振荡,常用的多模态非刚性配准方法可能无法取得满意结果。本文中,我们开发了一种新的两阶段非刚性配准方法来配准图像序列中的囊。首先,我们使用深度神经网络模型对感兴趣区域(即囊)进行分割。其次,我们获得最优变换并跨图像序列对齐囊。使用合成数据与真实囊数据进行评估,我们的方法大幅优于最先进(SOTA)的非刚性配准方法。

关键词

引用

@article{arxiv.1802.00491,
  title  = {A New Registration Approach for Dynamic Analysis of Calcium Signals in Organs},
  author = {Peixian Liang and Jianxu Chen and Pavel A. Brodskiy and Qinfeng Wu and Yejia Zhang and Yizhe Zhang and Lin Yang and Jeremiah J. Zartman and Danny Z. Chen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1802.00491},
  year   = {2018}
}

备注

Accepted at ISBI 2018