一种用于全二维气相色谱质谱数据分析的新峰检测方法
应用统计
2014-08-04 v1
摘要
我们开发了一种新的峰检测算法,用于分析全二维气相色谱飞行时间质谱(GCGC-TOF MS)数据,该算法使用正态 - 指数 - 伯努利(NEB)模型和混合概率模型。该算法首先利用 NEB 模型同时执行基线校正和去噪,并定义峰区域。然后使用概率分布混合模型选取峰,以处理共洗脱峰。基于同一峰组内峰之间的质谱相似性,进一步执行峰合并。我们利用实验数据评估了该算法,研究了不同条件贝叶斯因子截断值的影响以及不同混合模型(包括 Poisson、截断高斯、高斯、Gamma 和指数修正高斯(EMG)分布)的影响,并通过试错法引入了最优版本。随后,我们在化合物鉴定方面将新算法与两种现有算法进行了比较。数据分析表明,所开发的算法能够以比现有算法更低的错误发现率检测峰,且较简单的峰选取模型是更复杂且广泛使用的 EMG 混合模型的一个有前景的替代方案。
引用
@article{arxiv.1408.0095,
title = {A new method of peak detection for analysis of comprehensive two-dimensional gas chromatography mass spectrometry data},
author = {Seongho Kim and Ming Ouyang and Jaesik Jeong and Changyu Shen and Xiang Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1408.0095},
year = {2014}
}
备注
Published in at http://dx.doi.org/10.1214/14-AOAS731 the Annals of Applied Statistics (http://www.imstat.org/aoas/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)