基于稀疏框架乘子的MALDI质谱成像数据峰检测
图像与视频处理
2019-11-04 v1 数值分析
数值分析
摘要
MALDI质谱成像（MALDI MSI）是一种通过测量电离分子质荷比进行生物组织空间分辨分析的工具。随着MALDI MSI数据空间和质谱分辨率的提高，适当的数据分析与解释变得越来越具挑战性。将重要峰从噪声中可靠分离（即峰检测）是许多后续处理步骤的先决条件，且应尽可能准确。我们提出了一种基于稀疏框架乘子的新颖峰检测算法，该算法可直接应用于原始MALDI MSI数据而无需预先预处理。在一个模拟数据集上通过与一种最先进算法比较评估了其准确性。这些结果也显示了所提方法对基线和噪声效应的鲁棒性。此外，该方法在两个真实MALDI-TOF数据集上进行了评估，其中空间信息可被纳入峰拾取过程。
引用
@article{arxiv.1911.00491,
title = {Peak detection for MALDI mass spectrometry imaging data using sparse frame multipliers},
author = {Florian Lieb and Tobias Boskamp and Hans-Georg Stark},
journal= {arXiv preprint arXiv:1911.00491},
year = {2019}
}