多性状方法鉴定影响心脏结构/功能异常的遗传变异包括RGS3中的罕见突变
基因组学
2018-11-20 v1
摘要
心力衰竭是过早死亡的主要原因。鉴于心力衰竭综合征的异质性，鉴定心脏功能与结构的遗传决定因素可加深对心力衰竭的认识。尽管通过全基因组关联研究在理解心力衰竭遗传基础方面取得进展，心力衰竭的遗传度仍知之甚少。要进一步洞察导致心力衰竭的机制，需要超越单性状分析的系统性方法。我们整合贝叶斯多性状方法与贝叶斯网络，分析了3387名具有全外显子组测序数据的个体的10个心脏结构与功能相关性状。使用基于单性状的方法未发现任何显著遗传变异，而应用整合贝叶斯多性状方法，我们鉴定出位于RGS3、CHD3和MRPL38基因中的3个对新性状有显著影响的新变异，如左心室容积指数、胸骨旁长轴室间隔厚度和平均左心室壁厚度。其中，RGS3中的罕见变异NC_000009.11:g.116346115C>A (rs144636307)对左心室质量指数、左心室容积指数和左心房最大前后径表现出多效性影响，而RGS3可抑制与左心室扩张和收缩功能障碍相关的TGF-beta信号。
引用
@article{arxiv.1811.07838,
title = {A Multi-Trait Approach Identified Genetic Variants Including a Rare Mutation in RGS3 with Impact on Abnormalities of Cardiac Structure/Function},
author = {Akram Yazdani and Azam Yazdani and Raúl Méndez Giráldez and David Aguilar and Luca Sartore},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.07838},
year = {2018}
}