细胞增殖与死亡的多阶段模型:用 Erlang 分布追踪细胞分裂
细胞行为
2021-12-02 v1 动力系统
摘要
在体外或体内受刺激的淋巴细胞群随细胞分裂而增长。随机模型是合适的,因为一些细胞经历多轮分裂,一些死亡,而相同条件下同类型的其他细胞根本不分裂。若单个细胞行为独立,可设想每个细胞从分裂时间的密度函数中抽样。在数学和计算工作中最方便的选取——指数密度,高估了短分裂时间的概率。我们考虑一个产生分裂时间的 Erlang 分布和死亡时间的指数分布的多阶段模型。由此产生的竞争命运动力学是一种胞系(cyton)模型。使用近似贝叶斯计算,我们将模型与已发表的、在将 CFSE 标记的 OT-I 和 F5 T 细胞转移到淋巴细胞减少小鼠后获得的细胞计数进行比较。死亡速率假设随代次(分裂次数)线性缩放,且未分裂细胞(第代)的阶段数与至少分裂一次的细胞(代次大于零)不同。后验分布中偏好多阶段,且首次分裂的平均时间长于后续分裂的平均时间。
引用
@article{arxiv.2112.00371,
title = {A multi-stage model of cell proliferation and death: tracking cell divisions with Erlang distributions},
author = {Giulia Belluccini and Martín López-García and Grant Lythe and Carmen Molina-París},
journal= {arXiv preprint arXiv:2112.00371},
year = {2021}
}
备注
26 pages, 11 figures