测量布尔网络鲁棒性的蒙特卡洛方法
分子网络
2012-10-18 v1
摘要
生物网络中鲁棒性的涌现是进化生物体的一个首要特征，但在体内研究这一属性（无论是在遗传、代谢还是神经网络等任何表示层次上）都是一项非常艰巨的挑战。在遗传网络的情况下，数学模型已被用于在此背景下提供关于其鲁棒性的见解，但即使在相对简单的公式（如布尔网络 (BN)）中，对于大系统规模计算某些度量也可能不可行。我们在本工作中描述了一种蒙特卡洛方法，用于计算布尔网络最大吸引盆的大小，这与网络的鲁棒性内在相关，且该方法不受网络规模限制。我们通过有限尺寸分析展示了我们方法的稳定性，并通过在小网络上的全搜索进行了验证。
引用
@article{arxiv.1210.4679,
title = {A Monte Carlo Approach to Measure the Robustness of Boolean Networks},
author = {Vitor H. P. Louzada and Fabrício M. Lopes and Ronaldo F. Hashimoto},
journal= {arXiv preprint arXiv:1210.4679},
year = {2012}
}
备注
on 1st International Workshop on Robustness and Stability of Biological Systems and Computational Solutions (WRSBS)