人类基因组中SNP成簇分布的一个模型
基因组学
2016-05-24 v1
摘要
受 SNPs 非随机但成簇分布的刺激，我们引入了一个现象学模型来解释人类基因组中 SNPs 的成簇特性。该现象学模型基于向已有 SNPs 更近邻域的优先突变。利用 Hapmap SNP 数据，我们经验性地证明优先模型比随机模型更能阐释 SNPs 的成簇分布。此外，该模型不仅适用于常染色体，也适用于 X 染色体，尽管 X 染色体具有与常染色体不同的特征。对模型中估计参数的分析可以解释 X 染色体显著的群体结构和低遗传多样性。另外，参数间的相关性揭示了突变概率的群体间差异。这些结果支持了突变非独立性假说，而非随机突变。
引用
@article{arxiv.1605.06576,
title = {A model for the clustered distribution of SNPs in the human genome},
author = {Chang-Yong Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.06576},
year = {2016}
}
备注
17 pages, 4 figures