无性繁殖种群中进化的马尔可夫链模型：进化过程中的洞察与分析可处理性

进化过程已通过多种方式建模，包括随机模型和确定性模型。我们开发了一个无性繁殖生物种群进化的代数模型，其中我们将表型空间中的随机游走（受限于表示基因型的底层图的边）表示为一个时间齐次马尔可夫链。我们证明了该模型与更标准、显式的随机模型的等价性，并展示了代数模型在计算效率上的优越性。由于效率的提高，我们能够模拟更大种群在更真实基因型空间中的进化。此外，我们展示了马尔可夫链模型的代数性质如何为进化过程提供洞察，并允许使用熟悉的线性代数方法进行分析。