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DNA介导及其他价限制相互作用的通用理论

软凝聚态物质 2015-06-05 v3

摘要

我们提出了一种通用理论,用于预测DNA包被胶体之间的相互作用势,更广泛地说,任何通过价限制配体-受体结合相互作用的粒子。我们的理论正确地包含了在价限制相互作用中起关键作用的构型和组合熵因子。通过严格强制执行自洽性,它相对于详细的蒙特卡洛计算达到了接近定量的准确性。通过适当的近似和在特定几何形状下,我们的理论简化为先前成功的处理方法,这些方法现在统一在一个通用且可扩展的框架中。我们期望我们的工具对其他研究配体介导相互作用的科研人员有用。一个完整且文档齐全的Python实现可在http://github.com/patvarilly/DNACC免费获取。

关键词

引用

@article{arxiv.1205.6921,
  title  = {A general theory of DNA-mediated and other valence-limited interactions},
  author = {Patrick Varilly and Stefano Angioletti-Uberti and Bortolo M. Mognetti and Daan Frenkel},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1205.6921},
  year   = {2015}
}

备注

18 pages, 10 figures