系统综述：细胞涂绘（Cell Painting）的演进与影响

高内容图像基因测序在过去十年（2013-2023年）中推动了生命科学领域的诸多重大发现，包括对疾病病因、作用机制的新见解、新型治疗方案以及毒性预测。本文系统性地综述了细胞涂绘方法论的显著进展及其应用。进展包括对细胞涂绘方案的改进、针对不同扰动类型和应用场景的 assay 适配，以及对特征提取、质量控制和批次效应校正的方法改进。此外，机器学习方法最近在从细胞涂绘图像中提取生物学有用信息方面超越了经典方法。细胞涂绘数据可单独使用或与其他 -omics 数据结合使用，用于解明化合物的作用机制、毒性轮廓以及许多其他生物学效应。总体而言，关键的技术进步扩展了细胞涂绘捕捉细胞对各种扰动反应的能力。未来的进展很可能在于推进计算和实验技术、开发新的公开数据集以及将其与其他高内容数据类型集成。