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DNA热变性时的1/f温度涨落

生物物理 2011-11-10 v1

摘要

我们从理论上研究了DNA接近变性时的温度涨落,并观察到在临界温度下这些涨落的显著增强。尽管在低得多的频率范围内,Nagapriya等人最近的实验工作[Phys. Rev. Lett. 96, 038102 (2006)]也报道了这种急剧增加。我们表明,当朗之万方程中的耗散系数假定大于几十ps-1时,温度涨落反而没有增强,并指出了溶剂在真实实验中的可能作用。我们寻找了大泡生长与温度涨落增强之间可能的相关性,但没有发现直接证据。最后,我们表明,在单个碱基对的尺度上,既观察不到涨落的增强,也观察不到1/f依赖性,而当对大量碱基对的贡献求和时,这些性质才显现出来。因此,我们得出结论,这两种效应都源于集体运动,而集体运动是由变性时相关长度的发散所促进的。

关键词

引用

@article{arxiv.physics/0703074,
  title  = {1/f fluctuations of DNA temperature at thermal denaturation},
  author = {Marc Joyeux and Sahin Buyukdagli and Michael Sanrey},
  journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0703074},
  year   = {2011}
}