哪个更快：Bowtie2GP > Bowtie > Bowtie2 > BWA
基因组学
2013-01-23 v1
摘要
我们最近使用遗传编程自动生成了 Langmead 的 DNA 序列比对工具 Bowtie2 Sect.5.3 RN/12/09 的改进版本。我们发现，它比癌症研究所目前用于短下一代双端 DNA 序列的生物信息学测序工具（BWA）运行速度快四倍以上，占用内存更少，且在人类基因组中找到的匹配相似。
引用
@article{arxiv.1301.5187,
title = {Which is faster: Bowtie2GP > Bowtie > Bowtie2 > BWA},
author = {W. B. Langdon},
journal= {arXiv preprint arXiv:1301.5187},
year = {2013}
}
备注
4 pages, 2 tables