面向下一代测序的 Watterson 估计量：从三合体到同源多倍体
种群与进化
2015-09-22 v2 基因组学
定量方法
摘要
文献中已提出了多种针对下一代测序 (NGS) 数据变异性的 Watterson 估计量变体。我们提出了一个基于最大复合似然的广义 Watterson 估计量统一框架，该框架涵盖了大多数现有估计量。我们将这类无偏估计量提议为适用于广泛类别 NGS 数据（包括池化和三合体数据）的广义 Watterson 估计量。我们还讨论了其与文献中已提出估计量的关系，表明它们具有两种等价但看似不同的形式，并由此推导出一组组合恒等式作为副产品。最后，我们对针对单个或多个同源多倍体个体的 Watterson 估计量进行了详细论述。
引用
@article{arxiv.1309.4380,
title = {Watterson estimators for Next Generation Sequencing: from trios to autopolyploids},
author = {Luca Ferretti and Sebástian E. Ramos-Onsins},
journal= {arXiv preprint arXiv:1309.4380},
year = {2015}
}
备注
25 pages