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病毒 RNA 复制模式:进化与动力学启示

种群与进化 2014-11-27 v2 适应与自组织系统

摘要

病毒可通过不同的复制模式 (RMs) 扩增其基因组,范围从印模复制 (SMR) 模型到几何复制 (GR) 模型。由于突变积累速率的差异,不同的 RMs 预计会在病毒准种中产生不同的进化和动力学结果。理论和计算模型表明,虽然 SMR 可能为 RNA 病毒提供突变稳健性,但 GR 可能在对抗基因组降解方面赋予动力学优势。本文综述了正链单链 RNA 病毒 RM 研究的最新进展。对芜菁花叶病毒 (Turnip mosaic virus) RNA 链的动力学实验量化,结合非线性数学模型,表明该病原体符合 SMR 模型。本文进一步分析了用于自然感染的同一数学模型,并证明了涉及正链和负链病毒共存的内部平衡点是全局渐近稳定的。

关键词

引用

@article{arxiv.1411.6484,
  title  = {Viral RNA replication modes: evolutionary and dynamical implications},
  author = {Josep Sardanyés},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1411.6484},
  year   = {2014}
}

备注

Trends in Mathematics 2: 1-4 In: Emergence, Spread and Control of Infectious Diseases. (Research Perspectives CRM Barcelona - Springer) 2014