蛋白质系统中涨落-耗散定理的违反
统计力学
2007-07-09 v4 生物物理
摘要
我们报告了使用弹性网络模型对肌球蛋白进行的分子动力学模拟结果。对系统进行淬火后，我们观察到密度相关函数和密度响应函数的玻璃态行为，这些函数通常在结构玻璃和自旋玻璃中研究。在平衡态下，涨落-响应关系（涨落-耗散定理的一个代表性关系）成立，即密度相关函数与密度响应函数之比等于环境温度。我们表明，在我们研究的淬火系统中，这种关系可能被违反。在这种关系不成立的情况下，该比率可以被视为有效温度。我们发现肌球蛋白的这种有效温度高于环境温度。我们讨论了这种有效温度与肌球蛋白分子中ATP水解后发生的能量转导之间的关系。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0609494,
title = {Violation of the fluctuation-dissipation theorem in a protein system},
author = {Kumiko Hayashi and Mitsunori Takano},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0609494},
year = {2007}
}
备注
8 pages, to appear in Biophys. J