VIMs:基于文本到颜料扩散模型的虚拟免疫组织化学多染色技术
图像与视频处理
2024-07-30 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
本文提出了一种虚拟免疫组织化学多染色(Virtual Immunohistochemistry Multiplex staining,简称VIMs)模型,用于从单一的HE(hematoxylin and eosin,胞染-嗜酸染)组织切片生成多个免疫组织化学(IHC)染色。IHC染色在病理诊断中至关重要,用于解决复杂的诊断问题并指导患者治疗决策。尽管商业实验室提供多达400种不同的抗体IHC染色,但小Biopsy样本常缺乏足够组织进行多次染色,同时保留组织进行后续分子检测。这凸显了虚拟IHC染色的需求。值得注意的是,VIMs是首个解决此需求的模型,利用大型视觉语言单步扩散模型通过每个IHC标记的文本提示实现虚拟IHC多染色。VIMs在单倍染色配对的HE和IHC图像上进行训练,采用对抗性训练模块。VIMs的测试包括配对和非配对图像集。为提高计算效率,VIMs利用预训练的大型潜在扩散模型,通过低秩适配器(LoRA)方法进行微调。实验表明,针对核和细胞质IHC标记,VIMs的性能优于基础扩散模型,与Pix2Pix(用于配对图像翻译的标准生成模型)相当。采用多种评估方法,包括两位病理学家的评估,来确定VIMs的性能。此外,不同提示的实验也凸显了文本条件的影响。本文首次尝试通过仅使用单倍数据训练的单个模型,从单个HE输入生成多个IHC染色,展示了加速组织病理学研究的潜力。
引用
@article{arxiv.2407.19113,
title = {VIMs: Virtual Immunohistochemistry Multiplex staining via Text-to-Stain Diffusion Trained on Uniplex Stains},
author = {Shikha Dubey and Yosep Chong and Beatrice Knudsen and Shireen Y. Elhabian},
journal= {arXiv preprint arXiv:2407.19113},
year = {2024}
}
备注
Accepted to MICCAI Workshop 2024