解旋酶解开双链核酸的速度与持续合成能力
生物物理
2007-05-23 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
解旋酶是细胞中解开双链核酸（dsNA）的分子马达。许多解旋酶在单链（ss）核酸上具有方向性偏好，并将其定向易位与链分离耦合。易位与解旋耦合的模型使用相互作用势来表示被动和主动解旋酶机制。被动解旋酶必须等待热涨落打开 dsNA 碱基对，然后才能前进并抑制 NA 闭合。主动解旋酶直接 destabilizes dsNA 碱基对，加速打开速率。在此，我们将该模型扩展为包括解旋酶从核酸链上的解离。解旋酶的持续合成能力取决于相互作用势的形式。被动解旋酶的平均附着时间在 ss 易位和 ds 解旋之间不变，而主动解旋酶在解旋过程中的附着时间通常相对于 ss 易位有所减少。此外，我们描述了如果碱基对结合自由能改变，解旋酶解旋速度和持续合成能力如何变化。
引用
@article{arxiv.physics/0509138,
title = {Velocity and processivity of helicase unwinding of double-stranded nucleic acids},
author = {M. D. Betterton and Frank Julicher},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0509138},
year = {2007}
}
备注
To appear in special issue on molecular motors, Journal of Physics - Condensed Matter