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通过错误设定混合模型分析从高维全基因组关联研究中估计方差与置信区间

统计方法学 2021-01-19 v1 统计理论 统计理论

摘要

我们研究了从全基因组关联研究(GWAS)错误设定混合模型分析中对刻画遗传效应参数的方差估计及相关的置信区间。先前的研究表明,尽管存在模型错误设定,某些遗传关注的量仍是可估计的,并且可以在错误设定的线性混合模型下使用约束最大似然(REML)方法获得这些量的一致估计量。然而,此类 REML 估计量的渐近方差较为复杂,尚不便用于实际实现。在本文中,我们开发了实用且计算便捷的方法来估计此类渐近方差并构建相关的置信区间。所提方法的性能基于蒙特卡洛模拟和真实数据应用进行了实证评估。

关键词

引用

@article{arxiv.2101.06638,
  title  = {Variance Estimation and Confidence Intervals from High-dimensional Genome-wide Association Studies Through Misspecified Mixed Model Analysis},
  author = {Cecilia Dao and Jiming Jiang and Debashis Paul and Hongyu Zhao},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2101.06638},
  year   = {2021}
}

备注

21 pages