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北大西洋三维海洋生物地球化学区域的揭示:系统性聚类方法比较与验证

机器学习 2025-10-14 v2

摘要

定义海洋区域和水体有助于理解海洋过程,并可用于下游任务,如定义海洋保护区。然而,这些定义往往源于主观决策,可能导致误导性且不可重复的结果。本研究旨在通过系统比较NEMI框架(Native Emergent Manifold Interrogation, NEMI)中的聚类方法,客观地定义北大西洋的区域。约3亿次测量的盐度、温度和氧气、硝酸、磷酸和硅酸浓度值作为输入,用于各种聚类方法(k均值、层次聚类Wards方法以及基于密度的空间聚类带噪声应用(DBSCAN))。统一维度简化与投影(Uniform Manifold Approximation and Projection, UMAP)强调数据中的(不)相似性,同时降低维度。基于内部、外部和相对验证技术对聚类方法及其超参数进行系统性验证,结果表明UMAP-DBSCAN最能代表数据。令人惊讶的是,内部验证指标在比较聚类方法方面系统性不可靠。为解决随机变异性,进行了100次UMAP-DBSCAN聚类运行并按NEMI聚合,得到最终的321个聚类。通过集合重叠(88.81±1.8%88.81\pm1.8\%)和平均网格单元不确定性(15.49±20%15.49\pm20\%)评估了可重复性。地中海、深层大西洋水和拉布拉德海的案例研究显示,结果与常见水体定义高度一致。该研究通过系统性聚类方法比较,揭示了与以往概念(如Longhurst区域)更详细的区域划分。所采用的该方法客观、高效且可重复,将支持未来研究中海洋区域的生物地球化学差异及其变化。

关键词

引用

@article{arxiv.2504.18181,
  title  = {Unveiling 3D Ocean Biogeochemical Provinces in the North Atlantic: A Systematic Comparison and Validation of Clustering Methods},
  author = {Yvonne Jenniges and Maike Sonnewald and Sebastian Maneth and Are Olsen and Boris P. Koch},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2504.18181},
  year   = {2025}
}

备注

Submitted to Ecological Informatics. Images in this preprint are of lower resolution than in the journal submission