揭示构型空间网络的拓扑结构
统计力学
2009-11-13 v1 无序系统与神经网络
摘要
构型空间网络（CSN）是描述动力学系统模拟过程中采样构型集合及其动态连通性的有效方法。为了阐明CSN拓扑与支配系统动力学和热力学的基础自由能景观之间的联系，本文提供了一个解析解来解释度分布的重尾、邻居连通性和聚类系数。该推导有助于理解从简单二次势阱到β3s肽天然态以及二维晶格异质聚体等系统中普遍存在的CSN网络拓扑。此外，CSN被证明属于适应度模型所描述的复杂网络的一般类别。
引用
@article{arxiv.0704.2699,
title = {Uncovering the topology of configuration space networks},
author = {David Gfeller and Paolo De Los Rios and David Morton de Lachapelle and Guido Caldarelli and Francesco Rao},
journal= {arXiv preprint arXiv:0704.2699},
year = {2009}
}
备注
6 figures