通过拉伸实现的粘附蛋白复合物解离与去折叠：剪切与拉伸机械钳之间的相互作用
生物大分子
2015-02-26 v1
摘要
利用粗粒化分子动力学模拟，我们分析了机械诱导的CD48-2B4蛋白复合物解离与去折叠。该异二聚体是免疫系统不可或缺的组分：2B4是自然杀伤细胞上的受体，而CD48表达于多种免疫细胞表面。迄今为止，其机械稳定性尚未经实验或理论评估。我们发现解离过程强烈依赖于拉伸方向，并可能通过多条路径发生。有趣的是，CD48-2B4界面可划分为三个不同的区块，在抵抗拉力时作为单元行动。在实验可实现的拉伸速度下，特征机械稳定性力在100至200 pN之间，取决于拉伸方向。这些特征力不必与复合物分离行为中涉及的拉伸力相关，因为先前个体蛋白内涉及剪切的展开可能产生更高的力峰值。
引用
@article{arxiv.1502.07087,
title = {Unbinding and unfolding of adhesion protein complexes through stretching: Interplay between shear and tensile mechanical clamps},
author = {Bartosz Rozycki and Lukasz Mioduszewski and Marek Cieplak},
journal= {arXiv preprint arXiv:1502.07087},
year = {2015}
}
备注
published in "Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics"