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不同温度下缬氨酸在水中的输运性质

化学物理 2018-09-14 v1 材料科学 软凝聚态物质

摘要

使用 OPLS/AA 力场参数,在 293.20 K、303.20 K、313.20 K、323.20 K 和 333.20 K 温度下,对水中的缬氨酸及其二元混合物(NValN_{Val} =0.003 且 NwaterN_{water}=0.997,NN 表示摩尔分数)进行了分子动力学模拟。该工作使用 GROMACS 完成。已估算 OW-OW、H19-OW、N6-OW 和 C1/C3-OW 的径向分布函数(RDFs)。配位数也由自编 FORTRAN 程序确定。缬氨酸和水的自扩散系数通过均方位移(MSD)并利用爱因斯坦关系确定。二元混合物的互扩散系数使用 Darken 关系确定。扩散系数值与实验结果相符,偏差在 8.54% 以内。分析了扩散系数的温度依赖性,分析表明它们遵循阿伦尼乌斯行为。由阿伦尼乌斯图估算的能量与实验数据相符,水偏差在 13.04% 以内,体系偏差在 5.34% 以内。

关键词

引用

@article{arxiv.1809.04996,
  title  = {Transport properties of Valine in water at different temperatures},
  author = {Deepak Pandey and Narayan Prasad Adhikari},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1809.04996},
  year   = {2018}
}

备注

12 pages, 13 Figures