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从成像到基因组学:利用Transformer进行预测建模

计算机视觉与模式识别 2024-08-02 v1

摘要

在本研究中,我们提出了一种利用基于Transformer的模型从医学成像模态预测基因组信息的新方法。我们旨在通过利用Transformer网络来弥合成像与基因组数据之间的差距,从而允许从CT/MRI图像准确预测基因组谱型。目前大多数研究依赖全切片图像(WSI)来进行关联,而这些图像需要通过侵入性方法获取。我们提出仅使用可用的CT/MRI图像来预测基因组序列。我们基于Transformer的方法能够仅基于CT/MRI图像高效地生成多个序列之间的关联。这项工作为非侵入性成像模态在精准和个性化医疗中的应用铺平了道路,有助于更好地理解疾病和治疗。

关键词

引用

@article{arxiv.2408.00311,
  title  = {Translating Imaging to Genomics: Leveraging Transformers for Predictive Modeling},
  author = {Aiman Farooq and Deepak Mishra and Santanu Chaudhury},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2408.00311},
  year   = {2024}
}