从 3D-PLI 数据实现全鼠脑超高分辨率三维重建
计算机视觉与模式识别
2018-07-31 v1
摘要
鼠脑纤维连接性的微观尺度三维重建有助于深入认识脑复杂结构组织。我们提出一种针对 Wistar 鼠脑经三维偏振光成像（3D-PLI）获取的高分辨率与超高分辨率（64 m 与 1.3 m 像素尺寸）组织学图像配准与三维重建的新方法。我们的方法利用至多细胞分辨率的多尺度与多模态 3D-PLI 数据。我们提出一种基于特征变换的相似性测度与加权正则化方案，以实现准确鲁棒的非刚性配准。为将 1.3 m 超高分辨率数据变换至参考块面图像，提出先基于特征的配准、继以非刚性配准的方法。我们的方法已成功应用于鼠脑 278 张组织学切片，并利用专家手动放置的标志点对其性能作了定量评估。
引用
@article{arxiv.1807.11080,
title = {Towards ultra-high resolution 3D reconstruction of a whole rat brain from 3D-PLI data},
author = {Sharib Ali and Martin Schober and Philipp Schlöme and Katrin Amunts and Markus Axer and Karl Rohr},
journal= {arXiv preprint arXiv:1807.11080},
year = {2018}
}
备注
9 pages, Accepted at 2nd International Workshop on Connectomics in NeuroImaging (CNI), MICCAI'2018