表观遗传染色质沉默中的滴定效应与滞后现象
分子网络
2013-04-24 v3
摘要
通过可遗传的染色质修饰实现的表观遗传沉默机制在基因调控和细胞命运决定中起着主要作用。我们考虑了芽殖酵母中表观遗传染色质沉默的一个模型，研究了分岔图并表征了双稳态和单稳态机制。本文的重点是考察改变组蛋白修饰酶活性的扰动如何影响表观遗传状态。我们分析了将沉默蛋白总数设定为结合在核小体上的蛋白与环境中的可用蛋白之和为常数这一约束的含义。该约束通过共享的环境沉默蛋白库耦合了染色质的不同区域。我们表明，系统对扰动的响应显著依赖于由上述约束引起的滴定效应。特别是，对于一定范围的沉默蛋白总丰度，滞后环发生了定性变化，某些跳跃被不同状态的连续合并所取代。此外，我们发现基因表达对 Sir2 组蛋白去乙酰化活性的速率存在非单调依赖关系。我们讨论了如何将我们模型的这些定性预测与抗沉默药物作用下酵母系统的实验研究进行比较。
引用
@article{arxiv.1209.3802,
title = {Titration and hysteresis in epigenetic chromatin silencing},
author = {Adel Dayarian and Anirvan M. Sengupta},
journal= {arXiv preprint arXiv:1209.3802},
year = {2013}
}