蛋白质序列的三维混沌游戏表示
生物大分子
2023-03-20 v1 新兴技术
摘要
本论文探讨了一种蛋白质序列混沌游戏表示的新三维方法。介绍了DNA基础、蛋白质从DNA的合成、蛋白质结构与功能以及序列比对技术。简要讨论了理解混沌游戏表示与分形分析所需的数学背景。阐述了DNA序列混沌游戏表示的现有文献，并详细介绍了二维蛋白质序列混沌游戏表示及其优势与局限。我们探索了一种蛋白质序列混沌游戏表示的新三维方法（3D-CGR），并研究其能力：a）确定蛋白质序列的相似性与差异，b）研究氨基酸水平的二核苷酸偏倚对3D-CGR所得蛋白质同源性的影响，c）基于重排基序识别序列相似性，可用于研究外显子重排导致的蛋白质进化。
引用
@article{arxiv.2303.09683,
title = {Three dimensional chaos game representation of protein sequences},
author = {Annie Thomas},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.09683},
year = {2023}
}