曲率受挫小管中的热力学尺寸控制：具有开放边界的自限制
软凝聚态物质
2021-09-06 v1
摘要
我们使用计算建模研究一种基于粒子的几何受挫组装模型的组装热力学，其中亚基的局部堆积几何与均匀、无应变的大尺度组装不相容。该模型考虑离散三角形亚基，其驱动组装朝向封闭的、六方有序的小管，但具有局部偏好负高斯曲率的几何。我们使用动力学蒙特卡洛模拟和增强采样方法计算自由能景观以及相应的自组装行为，作为控制组装驱动力和受挫程度的实验可调控参数的函数。结果确定了发生有限温度自限制组装的参数范围，其中平衡组装尺寸分布围绕一个明确的有限尺寸急剧峰化。模拟还确定了系统摆脱受挫并组装到无限大尺寸的两种机制，并确定了抑制无限制增长的亚基的粒子尺度性质。
引用
@article{arxiv.2109.01174,
title = {Thermodynamic size control in curvature-frustrated tubules: Self-limitation with open boundaries},
author = {Botond Tyukodi and Farzaneh Mohajerani and Douglas M. Hall and Gregory M. Grason and Michael F. Hagan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2109.01174},
year = {2021}
}