二价阳离子对适配体识别神经递质靶标影响的理论分析
应用物理
2023-11-16 v2 介观与纳米尺度物理
摘要
基于适配体对脑内多巴胺与血清素等小分子的检测，需要在模拟体内环境且具生理离子浓度的溶液中表征特定适配体序列。尤其脑液中存在的二价阳离子（Mg2+ 与 Ca2+）已被证明会影响适配体在靶标识别时的构象动力学。因此，对于以适配体结构转换作为信号响应的生物传感器，探究二价阳离子对各独特适配体序列的影响至关重要。本文中，我们展示了分子动力学模拟预测多巴胺与血清素适配体在传感器表面行为的潜力。模拟实现了适配体构象变化的分子级可视化，其在某些情况下受二价阳离子显著影响。理论模拟与实验发现的相关性，验证了分子动力学模拟预测生物传感器上适配体特异性行为的潜力。
引用
@article{arxiv.2308.13396,
title = {Theoretical Analysis of Divalent Cation Effects on Aptamer Recognition of Neurotransmitter Targets},
author = {Douaki Ali and Stuber Annina and Hengsteler Julien and Momotenko Dmitry and Rogers David M. and Rocchia Walter and Hirst Jonathan D. and Nakatsuka Nako and Garoli Denis},
journal= {arXiv preprint arXiv:2308.13396},
year = {2023}
}
备注
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