用于富集分析的 XL-mHG 检验：技术报告
其他统计学
2015-09-25 v2
摘要
最小超几何检验（mHG）是一种用于检测排序二值列表中富集现象的有力非参数假设检验。本文详细回顾了其定义以及实现中所用的算法，这些算法能够高效计算精确的 p 值。随后我介绍了 mHG 的一种推广，称为 XL-mHG，它对被检验富集的类型提供了额外控制，并描述了计算其检验统计量和 p 值所需的精确算法修改。XL-mHG 算法是 GO-PCA 的构建模块，GO-PCA 是一种近期提出的利用先验知识对基因表达数据进行探索性分析的方法。
引用
@article{arxiv.1507.07905,
title = {The XL-mHG Test For Enrichment: A Technical Report},
author = {Florian Wagner},
journal= {arXiv preprint arXiv:1507.07905},
year = {2015}
}
备注
corrected terminology ("threshold" => "cutoff"); added section 5, "Quantifying the strength of enrichment"