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分子马达二态模型的平均速度

生物物理 2015-05-19 v2 数学物理 math.MP

摘要

分子马达的运动对于活细胞的生物物理功能至关重要。原则上,这种运动可以被视为一个多化学态过程。在此过程中,分子马达可以在不同化学态之间跳跃,并且在每个化学态中,马达在相应的势能中向前或向后运动。因此,数学上,分子马达的运动可以由几个耦合的一维跳跃模型或几个耦合的福克-普朗克方程来描述。为了了解分子马达的基本性质,本文将对最简单的情况进行详细分析:即只有两个化学态的情况。实际上,许多现有模型,如闪烁棘轮模型,都可以视为二态模型。从平均速度的显式表达式,我们发现即使每个态中的势能是周期性的,分子马达的平均速度也可能非零,这意味着在两个态中都没有能量输入到分子马达。同时,即使有能量输入到分子马达,平均速度也可能为零。通常,分子马达的速度不仅取决于两个态中的势能(或相应的正向和反向跃迁率),还取决于两个化学态之间的跃迁率。

关键词

引用

@article{arxiv.1007.1745,
  title  = {The mean velocity of two-state models of molecular motor},
  author = {Yunxin Zhang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1007.1745},
  year   = {2015}
}