果蝇孤儿基因的生命周期
基因组学
2014-01-23 v1
摘要
孤儿基因(orphan genes)局限于单一系统发育谱系，并以高速率涌现。虽然这预示着基因的积累，但基因数量在进化过程中却保持得非常稳定。这一悖论至今尚未解决。由于过去对孤儿基因的分析主要在较长的进化时间尺度上进行，孤儿基因的丢失一直未被探索。在此，我们研究了 Drosophila obscura 群组中近缘物种间的孤儿基因更替模式。我们表明，孤儿基因不仅以高速率涌现，而且也会迅速丢失。有趣的是，近期涌现的孤儿基因比旧的更容易丢失。此外，具有强雄性偏倚的高表达孤儿基因更容易被保留。由于丢失和保留的孤儿基因均显示出相似的功能保守性进化特征，我们提出孤儿基因的丢失并非由高序列进化速率所驱动，而是反映了谱系特异性的功能需求。
引用
@article{arxiv.1401.4956,
title = {The life cycle of Drosophila orphan genes},
author = {Nicola Palmieri and Carolin Kosiol and Christian Schlötterer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1401.4956},
year = {2014}
}
备注
47 pages, 19 figures