BOS-Lig 数据集：通过共识方法为 66,810 种实验合成配体精确确定配体电荷
化学物理
2026-04-08 v1 材料科学
摘要
理解配体性质对于过渡金属配合物的计算高通量筛选至关重要。然而，配体性质如净电荷以及其他信息（如应用领域）在晶体学数据集中常常缺失或记录不一致。在此，我们从剑桥结构数据库中整理的 126,985 个单核过渡金属配合物构建了一个配体数据集。利用一种结合配合物电荷、金属氧化态和晶体学观察共识的迭代电荷平衡工作流程，我们对 94,581 个已识别独特配体结构中的 66,810 个配体有信心地分配了净电荷，从而构建了波士顿开放壳层配体（BOS-Lig）数据集。该工作流程首先在均配位配合物中分配配体电荷，然后迭代地将这些分配推广到异配位环境，即使在直接电荷信息不可用的情况下也能推断电荷。我们分析了简单启发式方法（如八隅体规则）会失败的案例，并引入了一个纯度指标来识别我们的电荷分配可能出错的情况。每个配体还根据其金属配位原子以及是否存在多种变体（即半可塑性）进行分类。然后，我们将配合物与相关期刊摘要相关联，并应用主题建模工作流程将 25,146 个配体与涵盖反应性、氧化还原化学、生物化学和光物理化学等功能应用领域联系起来。总之，我们提供了一个基于实验的配体化学空间数据集，将电荷与功能应用相连接，作为计算筛选和数据驱动配体设计的基础。
引用
@article{arxiv.2604.06043,
title = {The BOS-Lig Dataset: Accurate Ligand Charges from a Consensus Approach for 66,810 Experimentally Synthesized Ligands},
author = {Roland G. St. Michel and Ryan J. Jang and Aaron G. Garrison and Ilia Kevlishvili and Heather J. Kulik},
journal= {arXiv preprint arXiv:2604.06043},
year = {2026}
}