遗传密码基础的对称性与最小原理
其他定量生物学
2017-04-05 v1
摘要
对称性概念在物理学中的重要性已得到确立：遗传密码是否同样如此？基于这一思路，几年前提出了一种基于连续对称性的遗传密码模型，称为“晶体基模型”。本文是对该模型及其部分初步应用和近期发展的综述。在给出有充分依据的数学模型介绍后，我们通过将其应用于密码子使用概率求和规则的制定与验证，以及建立氨基酸物理化学性质之间的关系和预测，阐明了该模型的适用性。随后，在此框架下为核苷酸和密码子定义了“生物自旋”结构，密码子-反密码子对之间的相互作用可简单地由（生物）自旋-自旋势表示。这构成了本文的第二部分，在此部分中，通过施加最小能量原理，可以对遗传密码的演化进行分析，其结果与普遍接受的演化图景高度吻合。对该相互作用模型的更精确研究提供了与数据一致的密码子偏倚信息。
引用
@article{arxiv.1704.00940,
title = {Symmetry and Minimum Principle at the Basis of the Genetic Code},
author = {A. Sciarrino and P. Sorba},
journal= {arXiv preprint arXiv:1704.00940},
year = {2017}
}
备注
To appear in BIOMAT 2016, 326 - 362, 2017