子图集成与利用图同构新启发式的模体发现

开发了一种基于顶点不变量的新启发式方法，以所需精度快速区分非同构图。该方法被应用于从大肠杆菌蛋白质相互作用网络中采样子图，并作为发现扩展模体的探针。使用其$N$节点子图（$N\leq 14$）的统计性质描述该网络结构。子图出现次数的Zipf图是稳健的幂律，在固定度序列重写网络时并不改变——尽管具体子图可能交换排名。但指数依赖于$N$。对更大子图的研究突显了不同$N$下的一些惊人模式。模体，或在子图集成中过度丰富的连通片，在给定节点数下比反模体具有更多边，且通常展现二分结构或趋近完全图。相反，反模体（即欠丰富的连通片）大多是树或至多含单个小环。向有向图的扩展是直接的。