关于图模式更灵活版本的一些结果
计算复杂性
2014-09-11 v2
摘要
本文研究的问题源于图模式（Graph Motif），这是一个2006年在生物网络背景下引入的问题。非正式地说，它涉及判断一个颜色多重集是否出现在一个顶点着色图的连通子图中。由于生物数据中的高噪声率，已经提出了该问题的更灵活定义。我们在本文中给出了图模式的两个不同优化变体的两个不可逼近性结果：一个是最大化解的大小，另一个是最小化从解中获得模式所需的颜色替换次数。我们还研究了图模式的一个决策版本，其中连通性约束被图模块性这一众所周知的概念所取代。虽然问题仍然是NP完全的，但它允许针对生物学相关参数化的FPT算法。
引用
@article{arxiv.1202.5184,
title = {Some results on more flexible versions of Graph Motif},
author = {Romeo Rizzi and Florian Sikora},
journal= {arXiv preprint arXiv:1202.5184},
year = {2014}
}