自组装多肽结构的强迹模型
组合数学
2018-08-28 v1 生物大分子
摘要
文献 [Design of a single-chain polypeptide tetrahedron assembled from coiled-coil segments, Nature Chemical Biology 9 (2013) 362--366] 提出了一种用于多肽纳米结构设计的新型自组装策略。文献 [Stable traces as a model for self-assembly of polypeptide nanoscale polyhedrons, MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 70 (2013) 317-330] 中的第一个数学模型（多肽纳米结构可自然地表示为多面体的骨架图）引入了稳定迹 (stable traces) 作为适当的数学描述，但我们发现它们在建模具有非常小（小于或等于 2）或大（大于或等于 6）度顶点的图时存在不足。我们引入了强迹 (strong traces) 以弥补上述两个缺陷。通过研究强迹与图嵌入之间的联系，我们证明了每个连通图都容许一个强迹。此外，我们还刻画了容许平行（ resp. 反平行）强迹的图。
引用
@article{arxiv.1308.4024,
title = {Strong Traces Model of Self-Assembly Polypeptide Structures},
author = {Gašper Fijavž and Tomaž Pisanski and Jernej Rus},
journal= {arXiv preprint arXiv:1308.4024},
year = {2018}
}
备注
14 pages, 3 figures