水环境中选定蛋白质与硫酸软骨素相互作用分析的统计方法

我们提出了一种统计方法，用于研究水环境中选定蛋白质与另一分子（例如两者均为滑液中润滑素的组成成分）之间的相互作用。该研究以黏蛋白动力学选定特征的一元时间序列为例，该黏蛋白在四种不同盐溶液中与硫酸软骨素（4和6）相互作用。我们的统计方法基于递归方法来分析分子动力学的选定特征。此类递归方法通常用于在约化相空间中重建分子系统的演化，其中考虑了过程中最重要的变量。具体而言，所分析的时间序列被划分为若干子序列记录，这些子序列预期携带有关分子系统的有意义信息。子序列的元素由恒定延迟时间滞后（在本例中为通过统计检验确定的参数）分隔，子序列的长度即为嵌入维数参数（采用Cao方法）。我们结合递归图方法与香农熵方法来分析子序列确定的鲁棒性。我们假设子序列的鲁棒性决定了分子系统动力学的某些特性。我们分析的是噪声相当高的特征，以证明此类特征会导致图形上看起来相似的递归图。根据递归图计算了香农熵。然而，我们已证明香农熵值高度依赖于所分析特征的延迟时间值。因此，需要 elaboration 一种更精确的递归图分析方法。为此，我们提出了可应用于自动分析递归图的随机游走方法。