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非运动性细菌在硬琼脂平板上的扩散:基于智能体与随机模拟的比较

计算物理 2017-11-15 v2 生物物理 细胞行为

摘要

我们使用基于智能体的模型和连续介质模型研究了非运动性细菌菌落在硬琼脂平板上的扩散。我们表明,扩散动力学取决于初始营养物浓度、运动性以及固有的种群噪声。种群涨落是基于智能体模型中固有的,而对于连续介质模型,我们使用随机 Langevin 方程对其进行建模。我们表明,内在的种群涨落与非线性扩散率耦合,导致在降低初始营养物浓度时,从扩散限制聚集 (DLA) 型形态向 Eden 型形态的转变。

关键词

引用

@article{arxiv.1706.05186,
  title  = {Spreading of non-motile bacteria on a hard agar plate: Comparison between agent-based and stochastic simulations},
  author = {Navdeep Rana and Pushpita Ghosh and Prasad Perlekar},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1706.05186},
  year   = {2017}
}

备注

11 pages, 7 figures