谱求和规则与DNA序列周期性搜索
定量方法
2011-04-05 v1
摘要
周期性模式在基因组DNA序列中发挥着重要的调控和结构作用。通常，潜在的周期性应在广义的统计意义下理解，因为相应的周期模式在分子进化过程中已被随机点突变和插入/缺失强烈扭曲。DNA序列中的潜周期性可以通过傅里叶变换有效展示。通过将观测到的周期性与参考随机序列的对应特征进行比较，获得了观测周期性的显著性准则。我们表明，严格的谱求和规则对显著性准则施加的限制可以用 De Finetti 分布合理描述。该分布提供了 Rayleigh 分布与精确组合理论之间方便的中间渐近形式。
引用
@article{arxiv.1104.0541,
title = {Spectral sum rules and search for periodicities in DNA sequences},
author = {V. R. Chechetkin},
journal= {arXiv preprint arXiv:1104.0541},
year = {2011}
}
备注
10 pages, 0 figures