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利用ASTRAL进行物种树估计:实践考量

种群与进化 2019-10-18 v2

摘要

ASTRAL是一种在推断一组基因树之后重建物种树的方法,正日益被用于系统基因组学分析。它在多物种溯祖模型下具有统计一致性,可扩展性好,并在模拟和实证研究中表现出高准确性。本章讨论了使用ASTRAL时的实践考量,首先回顾已发表的结果并指出利用ASTRAL进行物种树估计的优势与不足,随后详细说明了准备输入基因树、解释ASTRAL输出以及执行后续分析的最佳方式。

关键词

引用

@article{arxiv.1904.03826,
  title  = {Species Tree Estimation Using ASTRAL: Practical Considerations},
  author = {Siavash Mirarab},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1904.03826},
  year   = {2019}
}