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生态网络的空间约束聚类

应用统计 2014-02-24 v1

摘要

空间生态网络被广泛用于对具有地理参考的生物实体(例如种群或群落)之间的相互作用进行建模。对此类数据的分析通常采用两步法:首先识别包含相似生物实体的类群,随后利用空间信息以改善生态学解释。我们开发了一种整合方法,以检索在地理上接近且在生态上相似的节点类群。我们提出的基于模型的空间约束方法,通过在参数的最大似然估计中添加约束,将地理信息嵌入到正则化框架中。模拟研究与真实数据分析表明,我们的方法能够检测出具有生态学意义的复杂空间模式。该基于模型的框架允许我们在生态网络分析中考虑外部信息(例如地理邻近性、协变量),并且似乎是处理此类数据的一种颇具吸引力的替代方法。

关键词

引用

@article{arxiv.1402.5319,
  title  = {Spatially-constrained clustering of ecological networks},
  author = {Vincent Miele and Franck Picard and Stéphane Dray},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1402.5319},
  year   = {2014}
}