田间试验的空间模型
统计方法学
2016-07-29 v1 应用统计
摘要
农业田间试验分析的一个重要目标是通过对空间效应进行校正，获得基因型表现的良好预测。在实践中，这些校正往往十分复杂，因为存在不同类型的空间效应：由应用于田间小区的管理干预引起的效应，以及由各种不规则空间趋势引起的效应。本文提出了田间试验的模型，其中随机空间分量由张量积惩罚样条（P-splines）构成。一种特殊的 ANOVA 型重构导出了五个平滑加性空间分量，它们构成了具有五个未知方差分量的混合模型的基础。在此空间场之上，基因型、区组、重复和/或其他空间变异源的效应以标准方式通过混合模型进行描述。我们展示了遗传力的几种定义与遗传分量相关联的有效维度或有效自由度之间的关系。该方法通过大规模田间试验进行了说明。提供了一个 R 包。
引用
@article{arxiv.1607.08255,
title = {Spatial Models for Field Trials},
author = {María Xosé Rodríguez-Álvarez and Martin P. Boer and Fred A. van Eeuwijk and Paul H. C. Eilers},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.08255},
year = {2016}
}