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大基因组脊椎动物中 rag1 和 pomc 基因的缓慢进化

基因组学 2013-02-12 v1

摘要

越来越多的证据表明,许多脊椎动物谱系的进化速率存在显著差异。作为进化速率的一阶近似,我们评估了自分歧以来在姐妹支系内部及之间积累的中性 (dS) 和非中性 (dN) 替换量。我们发现,在鱼类中,四齿鲀形目(河豚)的进化速率快于鲤形目(淡水硬骨鱼),而鲤形目的进化速率又快于板鳃亚纲(鲨鱼、鳐鱼和魟鱼)。在蝾螈中也观察到了类似的速率变异: Plethodontidae 科的进化速率被发现几乎是 Hydromantes 谱系的两倍。我们讨论了占据广泛不同栖息地和生态位的不同脊椎动物谱系之间这种显著的替换速率变异的可能解释。

关键词

引用

@article{arxiv.1302.2182,
  title  = {Slow Evolution of rag1 and pomc Genes in Vertebrates with Large Genomes},
  author = {Bianca Sclavi and John Herrick},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1302.2182},
  year   = {2013}
}

备注

14 pages and 3 Figures