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血管内分子信号模拟:软件设计与在动脉粥样硬化形成中的应用

计算工程、金融与科学 2013-08-16 v1 软凝聚态物质 定量方法

摘要

本文介绍了一个名为BiNS2的软件平台,能够模拟血管内带有漂移的基于扩散的分子通信。本文的贡献有两方面。首先,从软件工程的角度详细描述了模拟器,突出了引入的创新和优化。将它们引入到先前版本的BiNS模拟器中,是为了提供在有限空间内模拟分子信号和通信势的功能。第二个贡献是利用BiNS2分析了血管内发生的一个特定通信过程——动脉粥样硬化形成,这是动脉粥样硬化斑块形成的初始阶段,由于血小板和内皮之间的异常信号传导。从通信的角度看,血小板充当移动发射器,内皮细胞是固定接收器,粘附在血管壁上,传输的信号是由血小板发射的分子脉冲组成。该模拟器允许评估信道延迟和传输信号在血管壁上的足迹,作为发射器距离血管壁的距离、信号强度和接收器灵敏度的函数。

关键词

引用

@article{arxiv.1306.0150,
  title  = {Simulation of Molecular Signaling in Blood Vessels: Software Design and Application to Atherogenesis},
  author = {Luca Felicetti and Mauro Femminella and Gianluca Reali},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1306.0150},
  year   = {2013}
}

备注

Submitted for publication to Nano Communication Networks, Elsevier