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Palabos-npFEM:用于细胞级血流模拟(数字血液)的软件

计算物理 2021-07-22 v1

摘要

Palabos-npFEM 是一个用于模拟具有完全解析组分的血流的计算框架。该软件解析红细胞和血小板等血细胞的轨迹与形变状态,以及它们之间的复杂相互作用。该工具结合了用于模拟血浆(流体相)的格子 Boltzmann 求解器 Palabos、用于解析血细胞(固相)的有限元方法(FEM)求解器,以及用于耦合两相的浸没边界法(IBM)。Palabos-npFEM 在仅 CPU 版本之外,提供在 GPU 上模拟可变形体的选项,因此该代码专为最快的超级计算机量身打造。该软件集成于 Palabos 核心库中,可在 Git 仓库 https://gitlab.com/unigespc/palabos 获取。它提供模拟多种设置的可能性,例如不同几何结构与血液参数,并且由于其模块化设计,允许外部求解器轻松替换所提供的求解器。

关键词

引用

@article{arxiv.2011.04332,
  title  = {Palabos-npFEM: Software for the Simulation of Cellular Blood Flow (Digital Blood)},
  author = {Christos Kotsalos and Jonas Latt and Bastien Chopard},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2011.04332},
  year   = {2021}
}